重庆医科大学附属永川医院眼科最早可追溯到成立于1939年的原江津地区医院五官科，1987年正式建立独立的眼科，经过70余年的学科建设，是渝西地区眼科领域规模最大、设备最先进、技术力量最强的集医疗、教学、科研为一体的、综合实力一流的眼病专业科室，是重庆医科大学眼科学专业的硕士研究生培养基地。历年来承担了国家、市、区及院校级科研项目多项。目前我科有医务工作人员30余人，医师15人（包括2名视光师），主任医师1人，副主任医师2人，主治医生5人，住院医师5人，视光师2人；其中硕士研究生导师2名，硕士研究生4名，博士研究生1名，在读硕士3名。科室设有角膜病、白内障、青光眼、眼底病、眼眶及眼整形美容、小儿眼科及斜弱视、眼视光学和屈光手术等多个专业组。
重医永川医院眼科具有深厚的学科建设历史和经验积累，医疗技术先进，可实施当今国际上通行的各种眼科手术，包括白内障人工晶体植入术、玻璃体视网膜手术、角膜屈光性手术、斜视、青光眼、眼整形及眼眶手术，并与国际同步，手术效果良好。尤其在角膜屈光矫正手术，已开展近视手术近十年，现引进了目前国际最先进的角膜屈光矫正手术系统，术后视觉质量更完美。
眼科还成立有眼视光中心，包括验配中心、弱视训练室、视觉训练室、角膜接触镜室等功能中心，已重点开展青少年近视防控综合干预、弱视儿童筛查及综合弱视训练等项目，采用目前技术成熟、科学证实的手段综合干预治疗近视和弱视，如采用角膜接触镜（MCT数字化角膜塑性镜和RGP硬性高透氧性接触镜）减少眼周边离焦，以及视觉训练增加调节灵活度等科学手段可有效控制近视发展；采用多项弱视训练综合治疗提高弱视儿童视力，并恢复其双眼视功能，完善视觉发育。
科室拥有准分子激光治疗仪、眼底激光治疗仪、YAG激光治疗仪、泪道激光治疗仪、超声乳化治疗仪、视网膜玻璃体切割系统、进口眼科手术显微镜2台（莱卡及蔡司VISU210）、国产眼科手术显微镜1台、罗兰电生理检查仪、法国光太眼科A/B超、Humphrey视野计、角膜地形图检查仪、角膜曲率计、角膜测厚仪、Topcon角膜内皮细胞检查仪、眼底照相及荧光素眼底血管造影仪、眼前节图像采集系统、光学相干断层成像仪（OCT）、进口非接触式眼压计（2台）、全自动综合验光仪、同视机弱视治疗仪等先进检查及治疗设备。